５．平成７年〜平成１０年

　平成７年、前年からの破竹の勢いで２部昇格を果たし注目を浴びた。しかし、この年に待ち 受けていたのはリーグ再編成と言うものであった。今まで２部は７チーム１ブロックで４ブロ ック制（２８チーム）となっていた。これを８チーム１ブロックで２ブロック制（１６チーム） へ平成７年の結果で再編成する仕組みである（３部以下はエリアリーグとなる）。　正に、２部 の上位校にならなければ（４位まで）降格に等しい結果となるのである。

各校必死の中、接線 をものにしたブルーライオンズは新２部残留を果たした。この結果の背景には東工大との死闘 （ラスト数秒の逆転ＴＤ）や膝の靭帯を切ってのエースＱＢ橋本要（２２期）と、病から復活 したＲＢ森脇君（２２期）との感動のＴＤ等、数々のドラマがあった。

　平成８年は３年生ＱＢ寺田を擁し、３部時代に鍛えたメンバーの活躍で優勝した。入替戦は 筑波大に惜敗し、２部残留となるも、今後のモラルのベースとなる年となった。

翌年、翌々年は怪我人が続出した。特に平成１０年はリーグ戦前半からのＱＢ中川（２５期） ＴＥ寺田（２５期）の負傷大きく、入替戦は強豪・新潟大に惜敗し、エリア降格を強いられた。 この頃よりフットボール人口が激減し始め、各大学とも勧誘に苦戦する状況となり、我が校も 含めた２部下位校は、選手層の薄さが深刻化し始める時代に突入していった。